被検水が通過する飼育環境におかれた魚類の発するパルス音を、所定の時間観測し、2回以上の連続したパルス音を含む発音セットにおける、一のパルス音から次のパルス音までの時間間隔の変化、所定の時間内のパルス音の回数の変化、又は所定の時間内の発音セットの頻度の変化のいずれかを算出することを含む、被検水の水質のモニタリング方法を提供する。2回以上の連続したパルス音を含む発音セットにおける、一のパルス音から次のパルス音までの時間間隔（T）の変化を算出することによる場合、時間間隔（T）が、予め測定しておいた通常の時間間隔（T0）よりも長くなったときに被検水が有害であると判定する。本発明に用いる魚類の好適な例は、メダカ（Oryzaislatipes）である。